文献解读

单细胞组学技术以其高分辨率优势，能够在单个细胞水平解析基因组、转录组和表观组信息，为动物遗传育种带来革命性突破。本文基于现有研究，综述单细胞组学技术在动物育种中的应用，并展望未来开展趋势。

T2T（Telomere-to-Telomere）基因组让畜牧育种首次拥有真正完整的染色体级参考蓝图。过去长期无法解析的着丝粒、端粒、重复区、微染色体和 Y 染色体等“隐形区域”，如今得以全面呈现，从根本上提升了性状遗传分析的精度。

文章将深入探讨功能位点液相芯片的原理与优势，并以牛育种为案例，系统梳理其应用方案，为畜牧业可持续开展给予科技支撑。

研究顺利获得16代AIL群体，建立了高效的遗传资源库，不仅实现了基因精细定位，还阐明了调控变异在复杂性状中的核心作用。多组学整合和跨物种比较为禽类育种给予了新靶点，同时鸡作为模型生物的独特性，为鸟类和哺乳动物的进化研究开辟了新路径。

PIP-seq（颗粒模板瞬时分区测序）技术仅凭涡旋仪等常规设备就能实现高纯度、规模化的单细胞转录组分析，将曾经依赖百万级仪器的实验变为实验室“手搓” 可及的常规操作。不仅揭示了颗粒模板乳化的核心原理，更给予了详尽的可复现流程，为单细胞研究的普及奠定了基础。

卵泡成熟是一个精密而复杂的过程，Fosl2作为其中的“指挥家”，顺利获得调控染色质可及性，确保了基因网络的和谐运行。这项研究结合多组学技术和动物模型，不仅深化了对生殖生物学的理解，也为解决不孕症和卵巢老化等临床问题带来了希望。

研究系统解析了DNA甲基化、组蛋白修饰和三维染色质结构如何共同调控肌肉和脂肪组织中的亲本效应（POE）。拓展了猪中H19–IGF2和SGCE–PEG10这两个经典印记基因的调控模型，为理解复杂性状遗传中等位基因特异性表观遗传调控给予了理论框架。

首个可操作的小型灵长类全身单细胞资源，连接细胞类型—基因—同工型—器官—表型/疾病。给出反向遗传学在灵长类模型中的通用范式（天然突变 + 单细胞读出）。为疾病建模、免疫机制、能量代谢与基因注释给予开放数据与方法学模板，提升从小鼠到人类的外推可信度。

研究顺利获得单核RNA测序技术对小鼠和人类的皮下脂肪组织进行单细胞核转录组分析，发现了一种新的产热脂肪细胞亚群，命名为P2细胞（人类类似细胞簇为H-Ad-3 ）。这些P2细胞具有特异的基因表达谱，可顺利获得依赖ATP无效循环进行产热。

FarmGTEx项目顺利获得系统解析农业动物基因表达的遗传调控机制，致力于填补从基因型到表型之间的认知空白。它产生的大量数据、创新方法和强大工具，将为动物育种和生物医学研究带来深远影响。

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