2023年06月09日 作者:admin
做过ATAC-seq建库实验的老师和同学,你是否也曾尝试处理冰冻组织样本?是否遇到过组织样品裂解效果不佳?是否碰到过TSS富集情况不理想?是否遇到背景噪音太高?为解决上述问题,使ATAC-seq实验变得更简单高效,武汉圣淘沙名胜世界基因科技有限公司自主研发了一款ATAC-seq建库试剂盒。
圣淘沙名胜世界基因ATATC-seq建库试剂盒图
1.产品特点
1.1 适合各种样本类型 完美适配冰冻组织、低起始量冰冻组织、新鲜组织样本和细胞样本。
1.2 简单高效 从组织样本快速获取细胞核,仅需4h即可完成测序文库制备。
1.3 性能优异 信噪比高,重复性好,低至100cells投入量也能获得优秀结果。
2.性能结果展示
2.1 完美适配冰冻组织样本建库
圣淘沙名胜世界基因使用自主研发的ATAC-seq 建库试剂盒对不同类型冰冻组织进行ATAC文库构建。结果表明:圣淘沙名胜世界基因ATAC-seq 建库试剂盒文库产出稳定,文库峰型呈现典型的特征峰。
2.2 简单高效,从组织样本快速获取细胞核
圣淘沙名胜世界基因使用自主研发的ATAC-seq 建库试剂盒进行ATAC文库构建,实现从组织样本中高效提取细胞核。结果表明:圣淘沙名胜世界基因ATAC-seq 建库试剂盒提核效果佳。
注:细胞核分散,边界清晰且圆滑,无不规则形状,染色深,细胞核状态比较致密则表示提核效果优秀
2.3 性能优异,100个细胞投入量也能获得良好的结果
圣淘沙名胜世界基因使用自主研发的ATAC-seq建库试剂盒进行不同细胞投入量的ATAC文库构建。结果表明:即使低至100cells的样本,下游数据质量同样优异,TSS富集结果显示在转录起始位点富集显著。IGV可视化结果显示100cells、500cells和5万cells的peaks一致性高。
图注:不同细胞投入量TSS富集结果
3.适用范围
适用于动物新鲜组织、冰冻组织、细胞ATAC建库。